https://frosthead.com

Ambitieus project om genomen van 1,5 miljoen soorten te starten

Vorige week lanceerde een wereldwijd consortium van wetenschappers officieel het Earth BioGenome Project. Zoals Kate Kelland bij Reuters meldt, noemen de donateurs het uitgebreide initiatief de volgende 'maanopname voor biologie'. Naar verwachting kost het $ 4, 7 miljard, het heeft als doel het DNA van de 1, 5 miljoen bekende soorten eukaryotische of complexe soorten leven op aarde te sequencen . Onderzoekers zeggen dat een DNA-kaart van zoveel soorten een nieuwe structuur zal hebben voor wat we weten over biologie, ecologie en biodiversiteit.

Volgens een persbericht gaat het project van start met een nieuwe inspanning van het Wellcome Sanger Institute, het Darwin Tree of Life Project genaamd, dat alle 66.000 eukaryotische soorten in de komende tien jaar wil sequencen. In totaal hebben 17 instellingen over de hele wereld, waaronder het Smithsonian, zich aangemeld voor het project en zullen hun plannen in de nabije toekomst schetsen.

Momenteel hebben wetenschappers alleen de genomen van de genomen van ongeveer 3500 soorten complex leven bepaald en slechts ongeveer 100 van de "referentiekwaliteit", die wordt gebruikt voor diepgaand onderzoek. Het toevoegen van tienduizenden genomen aan die lijst is ronduit revolutionair.

"We hebben het over nieuwe medicijnen, nieuwe brandstoffen voor de toekomst, " vertelt Julia Wilson van de Sanger Trust aan Victoria Gill bij de BBC. "We zijn momenteel beperkt door onze verbeelding - we kunnen ons niet eens voorstellen wat dit ons zou vertellen."

Het ambitieuze idee kwam voor het eerst samen in 2015 tijdens een bijeenkomst onder leiding van Harry A. Lewin, Universiteit van Californië, Davis onderscheiden professor in evolutie en ecologie; Gene Robinson, directeur van het Carl R. Woese University of Illinois 'Institute for Genomic Biology; en W. John Kress, onderzoek botanicus en curator in het Smithsonian's National Museum of Natural History.

De onderzoekers werden geïnspireerd door het Human Genome Project. Terwijl de historische sequencing van het menselijk genoom in 2003 meer dan tien jaar had geduurd en destijds ongeveer $ 3 miljard kostte (wat, als je rekening houdt met inflatie, naar schatting $ 5 miljard vandaag zou kosten), verminderde de enorme inspanning dramatisch kosten van sequentiediensten. Dat plaatst dit enorme project binnen het bereik van de mogelijkheden.

Na voltooiing denkt men dat het Earth BioGenome-project een exabyte aan gegevens of 1 miljard gigabytes zal produceren, die gratis online worden gedeeld.

Het is moeilijk te zeggen waar de genmapping toe zal leiden. "De hiaten in onze kennis zijn veel groter dan wat we weten, " vertelt Lewin de BBC. “Dus we vullen de puzzelstukjes niet eens in; het grootste deel van de puzzel is leeg. "

Maar zoals Jim Smith, wetenschappelijk directeur van de Wellcome Trust, opmerkt dat hetzelfde waar was toen onderzoekers een kwart eeuw geleden voor het eerst aan het Human Genome Project werkten. "[W] e kon zich niet voorstellen hoe de toen geproduceerde DNA-sequentie onderzoek vandaag zou transformeren in menselijke gezondheid en ziekte, " zegt Smith. “Een missie ondernemen om al het leven op aarde te sequencen is niet anders.”

Ambitieus project om genomen van 1,5 miljoen soorten te starten