https://frosthead.com

Dingo wint competitie voor 's werelds meest interessante genoom

Het klinkt als een argument dat wetenschappers misschien hebben tijdens een nachtje drinken: welk wezen heeft het meest interessante genoom ter wereld? Maar de vraag is meer dan een voorbijgaand mijmeren.

Biotechbedrijf Pacific Biosciences uit San Francisco heeft een openbare wedstrijd gehouden om te bepalen welke critter de eer moet krijgen. De winnaar: Sandy Maliki, een raszuivere Australische dingo in de woestijn. Het bedrijf zal nu het genoom van de dingo sequensen om onderzoekers te helpen het proces van domesticatie te bestuderen.

Sandy versloeg vier andere interessante finalisten in de competitie en ontving 41 procent van de publieke stemmen, die over de hele wereld werden uitgebracht. Dit is het vierde jaar dat het bedrijf de competitie sponsort. Het bedrijf nodigt onderzoekers uit om subsidievoorstellen in te dienen waarin wordt uitgelegd waarom de interessante planten en dieren die ze bestuderen, moeten worden gesequenced. Vervolgens haalt een commissie van wetenschappers de inzendingen terug naar vijf finalisten voor de laatste publieke stemming.

Dit jaar, de finalisten opgenomen de explosieve bombardier kever, die een kokend heet explosief gas uitzendt wanneer aangevallen; de roze duif, een bedreigd familielid van de uitgestorven dodo; een zeeslak die chloroplasten van algen en de tempelputadder steelt, wiens gif medicinale waarde kan hebben.

Terwijl Rhett Jones bij Gizmodo beweert dat de dingo heeft gewonnen omdat het schattig is - en internet houdt van schattig - denken de onderzoekers van de Universiteit van New South Wales die het voorstel samenstellen dat zijn genoom ook wetenschappelijke verdienste heeft.

Bill Ballard van UNSW vertelt Kim Arlington van The Sydney Morning Herald dat Darwin geloofde dat domesticatie een tweestapsproces was. De eerste stap is een natuurlijk voorkomend proces genaamd onbewuste selectie, dat leidt tot eigenschappen in een dier dat het geschikt zou kunnen maken voor domesticatie. De tweede stap is kunstmatige selectie, waarbij mensen die dieren selectief fokken om specifieke eigenschappen te versterken of te verminderen.

Sandy is een van de drie wilde dingo-pups die in 2014 in de woestijn in centraal Australië zijn achtergelaten. Rasechte dingo's zijn zeldzaam vanwege de wijdverspreide kruising met tamme honden. Sandy kan onderzoekers dus leren over onbewuste selectie en welke natuurlijke eigenschappen wilde honden geschikt maakten voor domesticatie.

Er zijn veel mensen die niets van dingo's weten. Het is niet duidelijk of het een soort huishond of een aparte soort is. Het is ook onbekend hoe ze in het Land Down Under zijn aangekomen. Maar aangezien de inheemse Australiërs dingo's niet domesticeerden, blijven rasechte dieren in wezen ongewijzigd sinds ze aankwamen.

"Sandy is echt een geschenk voor de wetenschap, " zegt Ballard in een persbericht. "[S] het vergelijken van Sandy's genoom zal helpen enkele van de genen te bepalen voor temperament en gedrag die ten grondslag liggen aan de overgang van wilde dieren naar perfecte huisdieren."

Ballard zegt ook dat er een conserveringsaspect is voor het sequentiëren van het genoom, omdat het onderzoekers in staat stelt tests te verbeteren om de genetische zuiverheid van dingoes te bepalen.

De gensequencing vindt plaats aan de Universiteit van Arizona met behulp van PacBio's Single Molecule, Real-Time (SMRT) sequentietechniek, die veel langere stukken DNA tegelijkertijd sequenteert in vergelijking met andere technieken. De gegevens worden vervolgens geanalyseerd door het Duitse bedrijf Computomics.

Vorig jaar won een soort plant die zware metalen uit de grond haalt de wedstrijd.

Dingo wint competitie voor 's werelds meest interessante genoom